Go to RNAiDB Home Adult Wild-type C. elegans Movie Wild-type C. elegans Movie Wild-type C. elegans Movie Wild-type C. elegans Movie
 
Tell me more about PhenoBlast

PhenoBlast: search the database for similar phenotypic signatures.

Enter a PhenoBlast query:
   Examples: AH6.5, npp-1 (Gene), PF:GL1_4E2, SA:yk331a3, Cenix:T26E3.3 (RNAi)

Signature set: Color set (non-binary signatures only):

Print how many rows of results?


The phenotypic signature contains 47 characters. Comparison included 47 characters.
Total records in database used for comparison = 161

Key:
     = WT ;        = Defect ;        = ? ;        = N/A  
M1 = number of matching non-WT characters; M0 = number of matching WT characters; MA = number of All Matches; LP_M1 = -log probability of matching non-WT character; LP_MA = -log probability of All Matches; REL_LP = RELative -log probabilty to Perfect
# RNAi Expt Gene(s) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 1
0
1
1
1
2
1
3
1
4
1
5
1
6
1
7
1
8
1
9
2
0
2
1
2
2
2
3
2
4
2
5
2
6
2
7
2
8
2
9
3
0
3
1
3
2
3
3
3
4
3
5
3
6
3
7
3
8
3
9
4
0
4
1
4
2
4
3
4
4
4
5
4
6
4
7
 M1   M0   MA   LP_M1   LP_MA   REL_LP 
1  PF:GL1_4F2   knl-3                                                                                               9 38 47 5.602 7.596 1.000
2  PF:GL1_6F10   lin-5                                                                                               6 27 33 3.450 4.652 0.441
3  PF:GL1_2C2   ndc-80                                                                                               5 36 41 2.857 4.586 0.428
4  PF:GL1_7A9   eft-1                                                                                               5 36 41 2.524 4.335 0.381
5  PF:GL1_1D12   mcm-6                                                                                               5 35 40 2.746 4.359 0.385
6  PF:GL1_4B6   F09G2.4                                                                                               5 34 39 2.773 4.561 0.424
7  PF:GL1_5G12   F33D11.10                                                                                               5 33 38 2.654 4.050 0.326
8  PF:GL1_5E10   C50F2.3                                                                                               5 32 37 2.818 4.457 0.404
9  PF:GL1_7D9   pri-1                                                                                               5 32 37 2.673 4.155 0.346
10  PF:GL1_6A9   K12D12.1                                                                                               5 26 31 2.877 3.850 0.289