Go to RNAiDB Home Adult Wild-type C. elegans Movie Wild-type C. elegans Movie Wild-type C. elegans Movie Wild-type C. elegans Movie
 
Tell me more about PhenoBlast

PhenoBlast: search the database for similar phenotypic signatures.

Enter a PhenoBlast query:
   Examples: AH6.5, npp-1 (Gene), PF:GL1_4E2, SA:yk331a3, Cenix:T26E3.3 (RNAi)

Signature set: Color set (non-binary signatures only):

Print how many rows of results?


The phenotypic signature contains 47 characters. Comparison included 7 characters.
Total records in database used for comparison = 161 Can't compare character 6 (?); 7 (?); 8 (?); 9 (?); 10 (?); 11 (?); 12 (?); 13 (?); 14 (?); 15 (?); 16 (?); 17 (?); 18 (?); 20 (?); 21 (?); 22 (?); 23 (?); 24 (?); 25 (?); 26 (?); 27 (?); 28 (?); 29 (?); 30 (?); 31 (?); 32 (?); 33 (?); 34 (?); 35 (?); 36 (?); 37 (?); 38 (?); 39 (?); 40 (?); 41 (?); 42 (?); 43 (?); 44 (?); 45 (?); 46 (?).

Key:
     = WT ;        = Defect ;        = ? ;        = N/A  
M1 = number of matching non-WT characters; M0 = number of matching WT characters; MA = number of All Matches; LP_M1 = -log probability of matching non-WT character; LP_MA = -log probability of All Matches; REL_LP = RELative -log probabilty to Perfect
# RNAi Expt Gene(s) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 1
0
1
1
1
2
1
3
1
4
1
5
1
6
1
7
1
8
1
9
2
0
2
1
2
2
2
3
2
4
2
5
2
6
2
7
2
8
2
9
3
0
3
1
3
2
3
3
3
4
3
5
3
6
3
7
3
8
3
9
4
0
4
1
4
2
4
3
4
4
4
5
4
6
4
7
 M1   M0   MA   LP_M1   LP_MA   REL_LP 
1  PF:GL1_4G9   emb-27                                                                                               4 3 7 3.343 3.356 1.000
2  PF:GL1_1A12   F22B3.4                                                                                               4 3 7 3.343 3.356 1.000
3  PF:GL1_8B10   rpt-2                                                                                               4 1 5 3.343 3.346 0.997
4  PF:GL1_8A9   rpn-7                                                                                               4 1 5 3.343 3.346 0.997
5  PF:GL1_4E9   rpt-5                                                                                               4 1 5 3.343 3.346 0.997
6  PF:GL1_5C1   plk-1                                                                                               3 3 6 2.498 2.511 0.707
7  PF:GL1_2E5   T01H3.4                                                                                               3 3 6 2.498 2.511 0.707
8  PF:GL1_6E9   rpn-3                                                                                               3 2 5 2.498 2.504 0.705
9  PF:GL1_7D6   F54B3.3                                                                                               3 1 4 2.498 2.501 0.704
10  PF:GL1_4E6   plk-1                                                                                               3 1 4 2.498 2.501 0.704